非靶标代谢组学可对有机体内源性代谢物进行全面、系统的分析,是一种无偏向的代谢组学分析,可以发现新的生物标记物或者发现差异代谢物。非靶标代谢组学可以同时检测大量代谢物信号,但其灵敏度和定性定量准确性较差。按照检测平台的不同,又可细分为LC-MS非靶标代谢组学和GC-MS非靶标代谢组学。
广泛靶标代谢组学是一种整合了非靶标代谢组“广泛性”和靶标代谢组“准确性”检测技术优点的新型代谢组检测技术,具有高通量、超灵敏、广覆盖、定性定量准等特点。
高通量靶标代谢组学整合了非靶标代谢组学和靶标代谢组学的技术优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶标代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。
宏蛋白组学是对微生物群落中的蛋白质进行大规模定性和定量,从而在分子水平上揭示微生物表型信息的一门学科。它可以运用质谱技术规模化地采集自然界微生物种群的蛋白质信息,并结合多种组学数据,开展微生物种群的遗传特征及其生物功能的研究。
产品特点
l 针对性的蛋白提取方法,提高宏蛋白提取效率;
l 专用的蛋白质数据库,提高蛋白鉴定准确性;
l 先进的质谱分析平台,产出高质量数据;
l 完整的数据分析流程,提供个性化数据分析。
普通蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。蛋白质组学本质上指蛋白质特征的大规模研究,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
研究方法
(1)Label free
蛋白质非标记定量技术(Label free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
产品特点:
l 无需同位素标记,操作简单,成本较低;
l 鉴定覆盖度、灵敏度较低;
l 不受样本数量的限制;
l 可以进行蛋白的“有/无”比较分析;
l 对质谱仪器设备要求较高,色谱和质谱需要同时有较好的稳定性和重复性。
(2)DIA
DIA技术,主要采用数据非依赖采集模式(Data-independentAcquisition,DIA),结合传统的数据依赖采集模式(Data-dependent Acquisition,DDA)构建参考谱图库,通过液质联用技术(LC-MS/MS)将整个质谱扫描质量范围分为若干窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,采集全部子离子信息。将得到的数据利用主流分析软件,进行蛋白组学的鉴定、定量及差异蛋白分析等。该技术无需指定目标肽段,可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,数据利用度大大提高。
产品特点:
l 鉴定敏感度高:可鉴定更多低丰度蛋白,提高定量分析可信度;
l 重复性提升:与DDA模式相比,DIA缺失值更少,数据可重复性更高;
l 适合大样本量:不受样本量限制,可用于大规模样本数量检测;
l 定量准确性高:CV值较低,定量准确性提高;
l 数据可回溯:数字化蛋白信息,可进行回溯。
(3)Direct DIA
Direct DIA(Direct Data-independent Acquisition)是采用非建库的方法进行的DIA技术,与传统DIA分析策略相比,Direct DIA不再进行DDA分级建库,而是利用机器深度学习实现直接通过搜索DIA原始文件谱图生成库。深度学习打分寻找谱峰碎裂规律,预测保留时间,去除假阳性结果。与DDA相比,其具有缺失值少、鉴定蛋白数目多、定量准确的优点;与传统DIA技术相比,这样大大降低了成本,鉴定到的蛋白数目与传统DIA的差距也越来越小。
产品特点:
l DIA全息扫描,数据完整性好,蛋白质覆盖率高;
l 不进行DDA建库,提高效率,降低实验成本;
l 数据缺失值少,重现性效果好,定量准确。
(4)TMT
TMT技术是一种定量蛋白质组学方法,基于化学标记的原理实现对多个样本中蛋白质的同时定量分析。该技术利用特定的化学试剂(TMT标签)将不同样本中的蛋白质进行标记,使其具有不同的质荷比,然后通过质谱仪的串联质谱(tandem mass spectrometry)进行定量分析。
产品特点:
l 高通量:TMT技术可以同时分析多个样本,提高分析效率;
l 高灵敏度:TMT技术具有较高的灵敏度,可以检测到低丰度蛋白质;
l 高定量精度:TMT技术提供准确的定量结果,可用于定量比较和趋势分析。