16S rDNA基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时常用的分子标志物，广泛应用于微生物生态学研究中。高通量qPCR（HT-qPCR）芯片检测技术的定量方法克服了测序组学方法在共效和精确定量方面的障碍，已被广泛应用于描述和解释各种生态系统中微生物的功能结构。
基于16S和高通量qPCR芯片的组学数据，从16S、功能基因层面分别筛选出组间差异的菌群和功能基因，然后基于两者丰度的相关性进行联合分析，多角度揭示特定菌群与特定功能基因之间的相关性，对于研究群落结构及功能具有重要意义。
联合分析优势
l 通过对菌群及功能基因层面的组学分析，互相验证；
l 同时实现从“因”和“果”两个方面探究生物学问题；
l 阐述菌群与功能基因间的关联机制更加全面地解析生物过程中的物种和功能调控机制。
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