真核转录组按照是否有参考基因组，主要分为两大类，真核有参转录组和真核无参转录组。
真核有参转录组：是指对已有参考基因组的真核生物或其组织、细胞等进行转录组测序。测序结果通过与参考基因组比对，可验证转录组测序的测序饱和度和基因覆盖度，同时可获得基因结构、基因表达差异和可变剪接等信息。
真核无参转录组：是指在没有参考基因组的情况下，对真核生物转录组进行测序。真核无参转录组测序时，首先，在获得原始数据后，需要对数据进行质控拼接为unigene，再以unigene为参考序列进行后续分析。也可以对多个样本进行差异基因表达分析和差异基因功能富集分析等，用于发现功能基因，为下一步研究提供方向。
产品特点
l 高覆盖度：单次转录组测序实验即可获取全面的编码 RNA 信息；
l 注释信息丰富：通过与各大数据库进行比对，可获得较为完整的转录组注释信息；
l 关联分析：可联合多个组学数据，开展跨组学关联分析。
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